Основной целью деятельности Учреждения является реализация единой государственной политики в области мониторинга состояния почв, сохранения плодородия, воспроизводства и рационального использования земель сельскохозяйственного назначения, безопасного обращения с пестицидами и агрохимикатами, семеноводства, карантина и защиты растений.